受款人或執票人喪失中華民國國庫支票（簡稱國庫支票），申請掛失止付程序如下：
一、 請先以口頭方式通知下列單位：
（一）發票日未逾一年者：應向國庫經辦行申請掛失止付。
（二）發票日已逾一年者：應向財政部國庫署辦理掛失止付。

二、 檢具下列文件向國庫經辦行辦理掛失止付：
（一）遺失票據申報書正本(pdf檔案)(用紙請洽國庫經辦行）。
（二）票據掛失止付通知書一式三份(pdf檔案)（用紙請洽國庫經辦行）。
（三）掛失止付受款人身份證明文件及印章；如受款人係公司行號時，除公司設立或變更登記表正本外，並備齊負責人身份證明文件及印章。
（四）如係委託他人代辦時，應附委託書(odt檔案)、受託人身份證明文件及印章。

三、 經向國庫經辦行辦妥掛失止付手續後，取得票據掛失止付通知書副本；國庫經辦行即備文檢附票據掛失止付通知書影本，送財政部國庫署備查補發。

四、 受款人或執票人尋獲已掛失國庫支票時，如該支票發票日已逾一年，應洽財政部國庫署取消止付；未逾一年者，應依下列手續辦理：
（一）填具「撤銷票據掛失止付申請書」(pdf檔案)（用紙請洽國庫經辦行），向原受理國庫經辦行取消掛失止付。
（二）國庫經辦行經向財政部國庫署查明尚未補發後，始得受理；並備文檢附票據掛失止付通知註銷申請書影本，送財政部國庫署備查。